Ходила к нам ГИТ, ходила.... нужен совет опытных коллег по предписанию от ГИТ

А как же государственные нормативные требования охраны труда?

Согласен в оценке ГОСТа, к которому я, к сожалению, не имею отношения. А вот теперь Минтруду РФ придется чесать репу. Есть несколько вариантов решения:
- полнейшее игнорирование ГОСТа - мол это документ инопланетян, а не межгосударственный и национальный стандарт России. Но такую обструкционистскую позицию вряд ли сумеют понять, учитывая состояние НПА об обучении, и поэтому она чревата серьёзным скандалом;
- срочное изготовление дублера стандарта, который теперь будет выпущен уже под эгидой Минтруда РФ. Благо, что здесь можно просто его быстро перепечатать один в один, сменив лишь реквизиты. Вполне приемлемый вариант, который может быть полноценной заменой ГОСТу, тем более, что за выполнение его требований можно будет по прежнему сдирать с работодателей три шкуры. Более того, если успеть туда добавить свою отсебятину, чтобы ещё больше поднапрячь работодателей, то тогда будет совсем здорово. Но есть единственная загвоздка - это прохождение обязательных процедур обсуждения проекта, экспертиза и подготовки к изданию НПА, ведь там могут напрочь зарубить проект, обвинив его в засилье обязательных требований к работодателям и их коррупционности. А втихаря также вряд ли получится. К тому же теперь придется получать одобрение у трехсторонней комиссии. То есть тоже сплошная головная боль;
- а можно, наконец, набраться мужества и отступиться от своих амбиций регламентировать всё и вся в вопросах обучения и проверки знаний на уровне обязательных требований. В конце концов есть ещё обязательные требования в ТК РФ, документах об образовании, многочисленных правилах по охране труда, в которых, кстати, тоже много несуразицы. Например, в тех же правилах по ОТ для работ на высоте, которые второй год будоражат специалистов на различных форумах. В Правилах по охране в электроустановках, которые, несмотря на недавние изменения к ним, никак не могут состыковаться с правилами безопасной эксплуатации ЭУ и т. п. Этот последний вариант может быть принят довольно легко и безболезненно: например, признанием того, что Порядок потерял силу и перестает действовать. И все вздохнут свободно и начнут-то наконец работать нормально, без оглядки на церберов, а в интересах охраны труда для работников своих организаций. Кстати этот вариант соответствует общей тенденции, направленной на сокращение нормативной базы обязательных требований и общего количества действующих НПА, в которых тонет само Минтруда РФ, в пользу рекомендуемых и методических нормативных документов.

Ситуация следующая, сотрудник уволился по соглашению сторон. Компенсацию получил. Теперь планирует писать жалобы во все надзорные органы.
Если он напишет жалобу в ИТ будет ли назначена внеплановая проверка?
Проверять будут только связанное с данным работником?

ГИТ рассматривает трудовые споры. Что бы ГИТ к вам пришёл сотрудник должен у вас работать или восстановиться. После увольнения по соглашению сторон практически невозможно восстановиться (если условия соглашения соблюдены).

Смотря, что напишет. Может и "в целом радея об угнетенных" , проверять будут по написанному. И зацепят по всему, что придет в голову (случайно выявилось при проверке).

Уверен что будет. Не зря есть сроки хранения документации и кадровой, и по охране труда (3,5,10 лет и более...), чтобы копнуть, если что...То, что он уже не работает официально, ну никак не основание отказать ему в рассмотрении жалобы, - человека, может, угнетали там годами и в один день турнули, а он и не успел, и не сообразил пойти пожаловаться...
Я недавно смотрел запись вебинара с инспекторшей ГИТ - так вот она как раз растолковывала все эти моменты с жалобами...

Жалоба бывшего работника не может быть рассмотрена в ГИТ, так как отсутствуют трудовые взаимоотношения

Харибда, соберись!)
Есть же разница между
и

В первом случае я имею право подать жалобу, так как работал в магазине и со мной не проводили ничего.
Во втором случае я не являюсь даже работником магазина.
Соответственно и отношений трудовых не было.
Жалобу в данном случае можно подать по линии защиты прав потребителей.

Это однозначно индивидуальный трудовой спор (ИТС) ст. 381, 382. Если будут звонить из ГИТ или придет распоряжение настаивайте на этом, пришлите им приказ об увольнении и другие документы подтверждающие, что на данный момент трудовых отношений нет, БОРИТЕСЬ.
ИТС только через суд, ГИТ это знает (но надеется, что вы не знаете) и такие жалобы по умолчанию не рассматриваются, более того им их запрещено рассматривать, если только вами не заинтирисуется ГИТ в своих интересах. А вот если человек напишет, что нарушаются требования по ОТ то ИТС не пройдет. Проверка может быть ТОЛЬКО по поставленным вопросам! Никогда, запомните, никогда не давайте ничего лишнего! Вы будете думать, что даете что-то оправдывающее вас, но для ГИТ это только возможность накопать в них других нарушений, не относящихся к вопросу. (правоприменительная практика московской ГИТ)