Годен с ограничениями...

а что у него реально есть эти вредные факторы?
если да, и по должностным он выполняет работы, связанные с этими вредными факторами, то вы обязаны перевести его на работу, исключающие эти факторы

У меня были слесаря сантехники, им по АРМ выставили класс условий труда 3.1, т.к. они работают с канализацией, а в ней ПДК не измеряется - достаточно наличия.
Что касается работ на высоте, то это работы, которые выполняются на высоте от 1,5 до 5 м от поверхности грунта, перекрытия или рабочего настила, над которым производятся работы с монтажных приспособлений или непосредственно с элементов конструкций, оборудования, машин и механизмов, при их эксплуатации, монтаже и ремонте. Мои сантехники такие работы не проводили, соответственно и инструкции по ОТ при работе на высоте не было. С шумом та же история.
Посмотрите в должностные обязанности, что они у Вас делают? Не в дизельной же они у Вас работают...

еще раз спрашиваю, вы его когда отправляли на м/о эти факторы указывали?

по логике мед заключение ГОДЕН но без высоты и шума... думаю можно допником

Пусть отдел кадров издаст приказ, что в соотвествии с мед заключением № от числа, выданного МУЗ "больница" слесаря-сантехника ФИО допустить к выполнению должностных обязанностей с ограничением доступа к высоте и воздействия шума. (Можно перечислить перечень работ выполнение которых запрещено данному сотруднику) Пусть он ознакомиться с приказом и его непосредственный руководитель.