Работники за штатом

Если Работодатель совсем "ни в какую" не прислушивается к вашим устным доводам, т.е. считает, что риски неузаконенных трудовых отношений (со всеми вытекающими) гораздо меньше иных рисков (финансовых и т.д.), то в этом случае постарайтесь огородить себя от возможных последствий проверок. Например, в двух экземплярах напишите служебку руководителю о нарушении целого раздела ТК РФ. Снимите ответственность с себя. Если морально тяжело - увольняйтесь.

А что касается фактического допущения или недопущения неоформленных работников, то, как мне кажется, допускать таких работников нужно в общем порядке. Хотя, таким образом, Вы при проверке лишь докажете факт наличия трудовых отношений той же Прокатуре РФ или ГИТ.