время работы вредных условиях труда чтобы была доплата(компенсация).

Natali Natali, если работник взял административный/очередной отпуск/больничный, то это время вычитается из рабочего и доплата на него не начисляется, т.к. при умножении на ноль любого числа выходит ноль. На класс условий труда это никак не влияет. К остальному добавляется 4% (или сколько у Вас).
Они могли не заметить или не обратить внимания. Не стоит ориентироваться на отсудствие штрафа после проверки, сегодня не увидели, завтра накатят по полной.