План основных мероприятий...

Отделите мух от котлет.
МЧС России (и его территориальные подразделения) относится к ФЕДЕРАЛЬНЫМ ОРГАНАМ исполнительной власти, а Управления по делам ГОЧС - органы управления ГОЧС местных органов власти (ОМСУ) города, района.
Есть ещё более высокий уровень - субъектовый: областной, краевой и т.п. В этом случае это могут быть Управления, департаменты и др. структуры администраций субъектов, т.е. органа исполнительной власти субъекта РФ.
В Вашем случае если организация находится только на территории одного муниципального образования, то согласовывается с органом управления ГОЧС этого МО. Если в нескольких МО, то возможно согласование с органом управления ОИВС РФ или с ГУ МЧС России по субъекту. Тут у кого какие порядки заведены.